按《江苏省“十一五”水污染物总量削减目标责任书（2006-2010年）》要求，国家考核我省太湖湖体5个重点湖区，考核指标为高锰酸盐指数、总磷、总氮和富营养化指数。2006年,太湖湖体5个重点湖区高锰酸盐指数全部达到2010年目标要求；总氮和综合营养状态指数则均未达到2010年目标要求；五里湖、西部沿岸区和东部沿岸区总磷也未达到2010年目标要求。全湖高锰酸盐指数达Ⅲ类水质标准，总磷达Ⅳ类水质标准。全湖平均处于中富营养水平。