2009年5月，全省125个国控断面中（实测121个），有39个断面水质在Ⅰ～Ⅲ类之间，占监测断面总数的32.2%；36个断面水质劣于Ⅴ类，占29.8%。与去年同期相比,Ⅰ～Ⅲ类断面比例上升了5.8个百分点，劣Ⅴ类断面比例下降了9.9个百分点。与上月相比，Ⅰ～Ⅲ类和劣于Ⅴ类比例分别下降了1.7和5.7个百分点。

    本月全省共监测90个集中式饮用水地表水源地(111个集中式饮用水源地中有地下水源地11个，备用水源地10个)，取水总量为29351万立方米，达标水量为29315万立方米，达标率为99.9%。省辖城市22个主要饮用水源地取水总量为14031万立方米，全部达标。

    淮河流域省界断面奎河黄桥水质达标（李集桥断面因河道清淤未开展监测）；国家考核断面水质达标率为88.6%，与去年同期和上月相比，均上升了4.5个百分点。南水北调东线江苏段水质达标率为84.6%，同比提高了20.3个百分点；与上月相比，达标率保持不变。城市重点水域达标率为90.9%，与上月相比，上升了9.1个百分点。

太湖湖体综合营养状态指数为59.6，同比下降2.3；国家考核断面达标率为82.4%，同比提高16.4个百分点；15条主要入湖河流有2条水质劣于Ⅴ类，劣于Ⅴ类数同比减少4条。总的来看，太湖流域各项综合性指标显示水质保持稳定。

    长江干流总体水质为优，10个控制断面水质全部达到目标要求，达标率为100%，同比保持稳定；入江支流45个控制断面中（实测44个）符合2010年水质目标要求的有36个，达标率为81.8%，同比提高了8.5个百分点。

    全省43个市界断面中，有18个水质达到考核要求，达标率为41.9%。与去年同期及上月相比，市界断面水质达标率均下降了9.3个百分点。